Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psd3Q2PFD7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psd3Q2PFD7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms