Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vax1Q2NKI2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Vax1Q2NKI2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms