Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna5Q2MKA5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chrna5Q2MKA5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Chrna5Q2MKA5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms