Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Shroom4Q1W617 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
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Shroom4Q1W617 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Shroom4Q1W617 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
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Shroom4Q1W617 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
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Shroom4Q1W617 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
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Shroom4Q1W617 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
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Shroom4Q1W617 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Shroom4Q1W617 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Shroom4Q1W617 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
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