Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptcd3Q14C51 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptcd3Q14C51 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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