Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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Tdrd9Q14BI7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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Tdrd9Q14BI7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tdrd9Q14BI7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
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Tdrd9Q14BI7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
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Tdrd9Q14BI7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
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Tdrd9Q14BI7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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Tdrd9Q14BI7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
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Tdrd9Q14BI7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
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Tdrd9Q14BI7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tdrd9Q14BI7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
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Tdrd9Q14BI7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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Tdrd9Q14BI7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tdrd9Q14BI7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tdrd9Q14BI7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tdrd9Q14BI7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tdrd9Q14BI7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Tdrd9Q14BI7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tdrd9Q14BI7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tdrd9Q14BI7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tdrd9Q14BI7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms