Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Rpusd3Q14AI6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Rpusd3Q14AI6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Rpusd3Q14AI6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Rpusd3Q14AI6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Rpusd3Q14AI6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd3Q14AI6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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