Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prok1Q14A28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prok1Q14A28 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms