Protein–RNA interactions for Protein: Q149F5

Tmem71, Transmembrane protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem71Q149F5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmem71Q149F5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmem71Q149F5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmem71Q149F5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem71Q149F5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tmem71Q149F5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tmem71Q149F5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tmem71Q149F5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tmem71Q149F5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmem71Q149F5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmem71Q149F5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmem71Q149F5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem71Q149F5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms