Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc162pQ0VG85 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc162pQ0VG85 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms