Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rundc1Q0VDN7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rundc1Q0VDN7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rundc1Q0VDN7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rundc1Q0VDN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms