Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hif3aQ0VBL6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hif3aQ0VBL6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hif3aQ0VBL6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms