Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tigd2Q0VBL1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tigd2Q0VBL1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms