Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem52bQ0VBF2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms