Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prelid2Q0VBB0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms