Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r181Q0P547 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r181Q0P547 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r181Q0P547 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms