Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TrioQ0KL02 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrioQ0KL02 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms