Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2bQ0KL01 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2bQ0KL01 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn2bQ0KL01 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms