Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc21bQ0HA38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ttc21bQ0HA38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc21bQ0HA38 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms