Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q08AU9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q08AU9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q08AU9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q08AU9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q08AU9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q08AU9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q08AU9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q08AU9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q08AU9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q08AU9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q08AU9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms