Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc4Q08624 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc4Q08624 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc4Q08624 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms