Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff1Q08423 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff1Q08423 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms