Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ebf1Q07802 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ebf1Q07802 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms