Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NrepQ07475 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NrepQ07475 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms