Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2Q07279 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2Q07279 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2Q07279 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2Q07279 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2Q07279 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2Q07279 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nfe2Q07279 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nfe2Q07279 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2Q07279 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms