Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp2Q06649 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp2Q06649 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp2Q06649 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms