Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrx2Q06348 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms