Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelbQ04863 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelbQ04863 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelbQ04863 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelbQ04863 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelbQ04863 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelbQ04863 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelbQ04863 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms