Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col6a1Q04857 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col6a1Q04857 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms