Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top1Q04750 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top1Q04750 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1Q04750 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1Q04750 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top1Q04750 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Top1Q04750 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms