Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smpd1Q04519 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smpd1Q04519 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms