Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg2Q03517 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms