Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl7Q03366 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl7Q03366 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms