Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Runx1Q03347 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Runx1Q03347 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms