Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddr1Q03146 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms