Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkczQ02956 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkczQ02956 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkczQ02956 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkczQ02956 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 313.9 ms