Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp39Q02525 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp39Q02525 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms