Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr1fQ02284 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms