Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctnnb1Q02248 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctnnb1Q02248 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctnnb1Q02248 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnb1Q02248 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnb1Q02248 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctnnb1Q02248 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms