Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ascl1Q02067 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ascl1Q02067 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ascl1Q02067 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms