Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd1Q01822 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms