Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mc1rQ01727 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms