Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gbp1Q01514 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms