Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec23aQ01405 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sec23aQ01405 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec23aQ01405 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms