Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col1a2Q01149 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col1a2Q01149 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms