Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrcdQ00LT2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms