Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfaQ00731 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VegfaQ00731 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VegfaQ00731 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VegfaQ00731 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VegfaQ00731 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VegfaQ00731 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms