Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp11aP98197 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11aP98197 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp11aP98197 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp11aP98197 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms