Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp9bP98195 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp9bP98195 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp9bP98195 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp9bP98195 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp9bP98195 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp9bP98195 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms