Protein–RNA interactions for Protein: P97861

Krt86, Keratin, type II cuticular Hb6, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt86P97861 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt86P97861 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt86P97861 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt86P97861 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt86P97861 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt86P97861 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt86P97861 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt86P97861 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt86P97861 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt86P97861 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt86P97861 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt86P97861 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt86P97861 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt86P97861 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt86P97861 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt86P97861 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt86P97861 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt86P97861 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt86P97861 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt86P97861 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt86P97861 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt86P97861 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt86P97861 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt86P97861 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt86P97861 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt86P97861 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt86P97861 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt86P97861 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt86P97861 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt86P97861 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt86P97861 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt86P97861 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt86P97861 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt86P97861 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt86P97861 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt86P97861 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt86P97861 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt86P97861 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms